Student Assistant (f/m/x) - Analysis of Human Placenta Organoid single-cell data

Das UFZ

Das Helmholtz-Zentrum für Umweltforschung – UFZ hat sich mit seinen 1100 Mitarbeiterinnen und Mitarbeitern als internationales Kompetenzzentrum für Umweltwissenschaften einen hervorragenden Ruf erworben. Wir sind Teil der größten Wissenschaftsorganisation Deutschlands – der Helmholtz- Gemeinschaft. Unsere Mission: Wir forschen für eine Balance zwischen gesellschaftlicher Entwicklung und langfristigem Schutz unserer Lebensgrundlagen – für eine nachhaltige Entwicklung.

Die Stelle

Die menschliche Plazenta ist ein zentrales Organ für die Entwicklung des Fetus und übernimmt wichtige Funktionen bei Nährstoffversorgung, Hormonproduktion und Immunregulation. Um plazentare Prozesse unter kontrollierten Bedingungen untersuchen zu können, gewinnen sogenannte Plazenta-Organoide zunehmend an Bedeutung. Diese Modelle bilden wichtige Eigenschaften des menschlichen Gewebes nach und stellen damit ein relevantes System für die biomedizinische und umwelttoxikologische Forschung dar.

Im vorliegenden Projekt werden Trophoblast-Organoide aus menschlichem Plazentagewebe gezüchtet und anschließend durch Single-Nucleus-RNA-Sequenzierung (snRNA-seq) sequenziert. Ziel ist es, die Zusammensetzung verschiedener Zellpopulationen sowie Unterschiede in der Genexpression in Abhängigkeit vom fetalen Geschlecht und der Schwangerschaftswoche zu charakterisieren. Die erzeugten Datensätze sollen genutzt werden, um biologische Variabilität besser zu verstehen und die Aussagekraft zukünftiger Studien mit Plazenta-Organoidmodellen zu verbessern.

Die HiWi-Stelle ist im Bereich der bioinformatischen Auswertung dieser Daten angesiedelt und bietet Einblicke in moderne Transkriptomik, datengetriebene Analyseverfahren und die aktuelle Literatur im Forschungsfeld der Plazentabiologie.

Ihre Aufgaben

• Analyse von Single-Nuclei-RNA-seq-Datensätzen aus Plazenta-Organoiden
• Aufbereitung, Organisation und Qualitätskontrolle der Daten
• Identifikation differentiell exprimierter Gene
• Durchführung von Trajektorienanalysen
• Integration und Visualisierung der Ergebnisse
• Literaturrecherche zur wissenschaftlichen Einordnung

Wir bieten

• Eine hervorragende Betreuung, die Ihre persönliche und professionelle Entwicklung unterstützt
• Spannende Einblicke in die Arbeit eines führenden Forschungsinstituts
• Die Chance, in interdisziplinären, internationalen Teams zu arbeiten und von vielfältigen Perspektiven zu profitieren
• Die Möglichkeit, von Anfang an eigene Ideen und Impulse einzubringen und aktiv mitzugestalten
• Moderne technische Ausstattung und IT-Service, um Ihre Arbeit optimal zu unterstützen

Ihr Profil

• Hintergrund in Informatik / Bioinformatik / Biologie
• Programmierkenntnisse in R

Arbeitsort

Leipzig

Arbeitszeit

13 Stunden / hours

Befristung

befristet / 6 Monate

Kontakt

Sebastian Canzler (sebastian.canzler@ufz.de)
Violeta Stojanovska (violeta.stojanovska@ufz.de)

Ihre Bewerbung

Um eine faire Auswahl zu gewährleisten, reichen Sie bitte ihre Bewerbung (Anschreiben, Lebenslauf, relevante Anlagen) ohne Foto, Altersangabe und Angaben zum Familienstand über unser Online-Portal ein.

Diversität und Inklusion

Das UFZ schätzt Vielfalt und setzt sich aktiv für die Chancengleichheit aller Beschäftigten unabhängig von ihrer Herkunft, Religion, Weltanschauung, Behinderung, des Alters und der sexuellen Identität ein.
Wir freuen uns auf Menschen, die diverse Hintergründe, Identitäten und Perspektiven repräsentieren. Daher ermutigen wir insbesondere Menschen, die von struktureller Diskriminierung betroffen sind, sich bei uns zu bewerben.

Bewerbungsfrist: 30.04.2026